Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
LACTB2Q53H82 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LACTB2Q53H82 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms