Protein–RNA interactions for Protein: Q3SX64

ODF3L2, Outer dense fiber protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3L2Q3SX64 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ODF3L2Q3SX64 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ODF3L2Q3SX64 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms