Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL40Q2TBA0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL40Q2TBA0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms