Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DUSP6Q16828 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DUSP6Q16828 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
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