Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC6Q16204 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC6Q16204 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
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