Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKIV2LQ15477 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKIV2LQ15477 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms