Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

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Length 1,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PSME4Q14997 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PSME4Q14997 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
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