Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL4A6Q14031 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL4A6Q14031 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
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