Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
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KCNC3Q14003 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNC3Q14003 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
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KCNC3Q14003 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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KCNC3Q14003 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
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KCNC3Q14003 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNC3Q14003 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
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