Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC2Q13868 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
EXOSC2Q13868 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms