Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACNA1SQ13698 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACNA1SQ13698 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
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