Protein–RNA interactions for Protein: Q13445

TMED1, Transmembrane emp24 domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1Q13445 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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TMED1Q13445 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TMED1Q13445 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TMED1Q13445 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
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