Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PDE3BQ13370 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
PDE3BQ13370 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PDE3BQ13370 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
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