Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KLF1Q13351 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KLF1Q13351 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms