Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
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SKP2Q13309 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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SKP2Q13309 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SKP2Q13309 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SKP2Q13309 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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