Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SRSF6Q13247 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRSF6Q13247 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRSF6Q13247 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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