Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NME3Q13232 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME3Q13232 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME3Q13232 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME3Q13232 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME3Q13232 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME3Q13232 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME3Q13232 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME3Q13232 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME3Q13232 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NME3Q13232 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NME3Q13232 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NME3Q13232 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME3Q13232 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME3Q13232 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME3Q13232 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME3Q13232 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME3Q13232 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME3Q13232 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME3Q13232 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME3Q13232 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME3Q13232 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NME3Q13232 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME3Q13232 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME3Q13232 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME3Q13232 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME3Q13232 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME3Q13232 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME3Q13232 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME3Q13232 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME3Q13232 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME3Q13232 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NME3Q13232 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME3Q13232 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME3Q13232 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME3Q13232 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME3Q13232 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NME3Q13232 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME3Q13232 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME3Q13232 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME3Q13232 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME3Q13232 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME3Q13232 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME3Q13232 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME3Q13232 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME3Q13232 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NME3Q13232 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME3Q13232 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME3Q13232 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME3Q13232 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME3Q13232 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME3Q13232 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME3Q13232 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME3Q13232 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME3Q13232 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NME3Q13232 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME3Q13232 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME3Q13232 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME3Q13232 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME3Q13232 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME3Q13232 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME3Q13232 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME3Q13232 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME3Q13232 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME3Q13232 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME3Q13232 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME3Q13232 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME3Q13232 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME3Q13232 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NME3Q13232 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NME3Q13232 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME3Q13232 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME3Q13232 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME3Q13232 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME3Q13232 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME3Q13232 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME3Q13232 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NME3Q13232 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME3Q13232 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME3Q13232 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NME3Q13232 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME3Q13232 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME3Q13232 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME3Q13232 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME3Q13232 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NME3Q13232 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NME3Q13232 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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