Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHAF1BQ13112 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHAF1BQ13112 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms