Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRJQ12913 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRJQ12913 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms