Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COX10Q12887 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COX10Q12887 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COX10Q12887 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COX10Q12887 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COX10Q12887 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COX10Q12887 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COX10Q12887 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COX10Q12887 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
COX10Q12887 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
COX10Q12887 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
COX10Q12887 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COX10Q12887 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COX10Q12887 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COX10Q12887 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
COX10Q12887 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COX10Q12887 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COX10Q12887 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COX10Q12887 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COX10Q12887 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COX10Q12887 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COX10Q12887 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COX10Q12887 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COX10Q12887 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COX10Q12887 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
COX10Q12887 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
COX10Q12887 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COX10Q12887 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COX10Q12887 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COX10Q12887 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COX10Q12887 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COX10Q12887 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
COX10Q12887 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COX10Q12887 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COX10Q12887 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COX10Q12887 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COX10Q12887 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COX10Q12887 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COX10Q12887 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
COX10Q12887 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
COX10Q12887 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COX10Q12887 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
COX10Q12887 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COX10Q12887 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COX10Q12887 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COX10Q12887 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COX10Q12887 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COX10Q12887 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
COX10Q12887 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COX10Q12887 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COX10Q12887 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
COX10Q12887 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COX10Q12887 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COX10Q12887 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COX10Q12887 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COX10Q12887 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COX10Q12887 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COX10Q12887 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COX10Q12887 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COX10Q12887 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COX10Q12887 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
COX10Q12887 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
COX10Q12887 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
COX10Q12887 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COX10Q12887 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COX10Q12887 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COX10Q12887 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COX10Q12887 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COX10Q12887 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COX10Q12887 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COX10Q12887 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COX10Q12887 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COX10Q12887 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COX10Q12887 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
COX10Q12887 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COX10Q12887 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
COX10Q12887 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
COX10Q12887 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COX10Q12887 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COX10Q12887 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COX10Q12887 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
COX10Q12887 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
COX10Q12887 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms