Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMARCB1Q12824 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMARCB1Q12824 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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