Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC173Q0VFZ6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC173Q0VFZ6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms