Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RASGEF1BQ0VAM2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms