Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD47Q08722 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD47Q08722 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CD47Q08722 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD47Q08722 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CD47Q08722 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD47Q08722 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CD47Q08722 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD47Q08722 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CD47Q08722 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD47Q08722 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD47Q08722 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD47Q08722 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CD47Q08722 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD47Q08722 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD47Q08722 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD47Q08722 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD47Q08722 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CD47Q08722 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CD47Q08722 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CD47Q08722 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD47Q08722 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD47Q08722 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD47Q08722 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD47Q08722 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD47Q08722 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CD47Q08722 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CD47Q08722 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD47Q08722 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD47Q08722 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD47Q08722 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD47Q08722 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD47Q08722 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CD47Q08722 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD47Q08722 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CD47Q08722 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CD47Q08722 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD47Q08722 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD47Q08722 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD47Q08722 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD47Q08722 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD47Q08722 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD47Q08722 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD47Q08722 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CD47Q08722 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD47Q08722 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD47Q08722 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CD47Q08722 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CD47Q08722 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD47Q08722 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD47Q08722 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD47Q08722 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CD47Q08722 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD47Q08722 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD47Q08722 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD47Q08722 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD47Q08722 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CD47Q08722 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CD47Q08722 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CD47Q08722 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD47Q08722 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD47Q08722 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD47Q08722 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD47Q08722 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD47Q08722 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD47Q08722 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD47Q08722 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD47Q08722 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD47Q08722 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD47Q08722 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CD47Q08722 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CD47Q08722 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms