Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE4BQ07343 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PDE4BQ07343 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDE4BQ07343 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms