Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GABPB1Q06547 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GABPB1Q06547 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GABPB1Q06547 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms