Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CACNA1DQ01668 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms