Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD1P98174 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD1P98174 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FGD1P98174 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FGD1P98174 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD1P98174 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD1P98174 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD1P98174 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD1P98174 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD1P98174 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD1P98174 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD1P98174 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD1P98174 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD1P98174 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD1P98174 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD1P98174 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD1P98174 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD1P98174 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD1P98174 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD1P98174 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FGD1P98174 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FGD1P98174 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FGD1P98174 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FGD1P98174 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FGD1P98174 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD1P98174 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD1P98174 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD1P98174 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD1P98174 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD1P98174 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD1P98174 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD1P98174 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD1P98174 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD1P98174 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD1P98174 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD1P98174 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD1P98174 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD1P98174 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD1P98174 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FGD1P98174 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD1P98174 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD1P98174 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD1P98174 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD1P98174 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD1P98174 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD1P98174 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD1P98174 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD1P98174 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD1P98174 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD1P98174 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FGD1P98174 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD1P98174 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD1P98174 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD1P98174 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD1P98174 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD1P98174 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD1P98174 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD1P98174 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD1P98174 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD1P98174 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD1P98174 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD1P98174 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD1P98174 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FGD1P98174 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGD1P98174 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGD1P98174 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGD1P98174 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGD1P98174 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGD1P98174 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FGD1P98174 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FGD1P98174 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGD1P98174 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FGD1P98174 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGD1P98174 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FGD1P98174 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD1P98174 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD1P98174 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD1P98174 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD1P98174 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD1P98174 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD1P98174 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FGD1P98174 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms