Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTRA4P83105 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HTRA4P83105 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms