Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CRB1P82279 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
CRB1P82279 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CRB1P82279 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CRB1P82279 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CRB1P82279 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CRB1P82279 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CRB1P82279 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CRB1P82279 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CRB1P82279 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CRB1P82279 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CRB1P82279 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CRB1P82279 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CRB1P82279 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
CRB1P82279 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CRB1P82279 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CRB1P82279 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRB1P82279 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRB1P82279 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRB1P82279 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRB1P82279 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRB1P82279 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CRB1P82279 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CRB1P82279 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRB1P82279 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CRB1P82279 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CRB1P82279 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRB1P82279 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRB1P82279 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CRB1P82279 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRB1P82279 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRB1P82279 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRB1P82279 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRB1P82279 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRB1P82279 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRB1P82279 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRB1P82279 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRB1P82279 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRB1P82279 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRB1P82279 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRB1P82279 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CRB1P82279 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRB1P82279 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRB1P82279 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRB1P82279 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRB1P82279 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CRB1P82279 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CRB1P82279 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRB1P82279 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CRB1P82279 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRB1P82279 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRB1P82279 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRB1P82279 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRB1P82279 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRB1P82279 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRB1P82279 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CRB1P82279 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRB1P82279 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CRB1P82279 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRB1P82279 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRB1P82279 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRB1P82279 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRB1P82279 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRB1P82279 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRB1P82279 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRB1P82279 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRB1P82279 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRB1P82279 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRB1P82279 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRB1P82279 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CRB1P82279 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CRB1P82279 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRB1P82279 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRB1P82279 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRB1P82279 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRB1P82279 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CRB1P82279 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRB1P82279 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRB1P82279 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRB1P82279 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CRB1P82279 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRB1P82279 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRB1P82279 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRB1P82279 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CRB1P82279 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CRB1P82279 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRB1P82279 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRB1P82279 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CRB1P82279 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRB1P82279 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRB1P82279 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRB1P82279 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRB1P82279 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRB1P82279 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRB1P82279 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRB1P82279 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRB1P82279 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRB1P82279 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CRB1P82279 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CRB1P82279 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms