Protein–RNA interactions for Protein: P78556

CCL20, C-C motif chemokine 20, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20P78556 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL20P78556 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL20P78556 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL20P78556 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL20P78556 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL20P78556 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL20P78556 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCL20P78556 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL20P78556 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL20P78556 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL20P78556 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL20P78556 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL20P78556 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL20P78556 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL20P78556 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL20P78556 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL20P78556 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL20P78556 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL20P78556 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL20P78556 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL20P78556 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL20P78556 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL20P78556 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL20P78556 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL20P78556 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL20P78556 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL20P78556 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL20P78556 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL20P78556 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL20P78556 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL20P78556 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL20P78556 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL20P78556 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL20P78556 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL20P78556 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL20P78556 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL20P78556 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL20P78556 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL20P78556 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL20P78556 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL20P78556 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL20P78556 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL20P78556 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL20P78556 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL20P78556 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL20P78556 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL20P78556 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL20P78556 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL20P78556 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL20P78556 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL20P78556 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL20P78556 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL20P78556 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL20P78556 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL20P78556 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL20P78556 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL20P78556 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CCL20P78556 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CCL20P78556 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms