Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SUMO1P63165 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SUMO1P63165 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms