Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNB1P62873 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
GNB1P62873 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNB1P62873 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNB1P62873 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNB1P62873 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNB1P62873 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNB1P62873 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNB1P62873 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNB1P62873 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
GNB1P62873 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
GNB1P62873 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
GNB1P62873 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB1P62873 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB1P62873 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB1P62873 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB1P62873 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB1P62873 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB1P62873 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB1P62873 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB1P62873 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB1P62873 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB1P62873 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB1P62873 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB1P62873 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB1P62873 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GNB1P62873 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB1P62873 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB1P62873 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB1P62873 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB1P62873 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB1P62873 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB1P62873 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB1P62873 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GNB1P62873 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB1P62873 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB1P62873 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB1P62873 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB1P62873 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB1P62873 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB1P62873 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB1P62873 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB1P62873 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB1P62873 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB1P62873 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GNB1P62873 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNB1P62873 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNB1P62873 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNB1P62873 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNB1P62873 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNB1P62873 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNB1P62873 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GNB1P62873 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB1P62873 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB1P62873 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GNB1P62873 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms