Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HERVK_113P62684 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HERVK_113P62684 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms