Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2MP61081 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2MP61081 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2MP61081 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2MP61081 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2MP61081 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBE2MP61081 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE2MP61081 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE2MP61081 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE2MP61081 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE2MP61081 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBE2MP61081 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms