Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RAB2AP61019 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RAB2AP61019 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms