Protein–RNA interactions for Protein: P58557

YBEY, Endoribonuclease YbeY, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBEYP58557 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YBEYP58557 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YBEYP58557 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YBEYP58557 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBEYP58557 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBEYP58557 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBEYP58557 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBEYP58557 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBEYP58557 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBEYP58557 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBEYP58557 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBEYP58557 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBEYP58557 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBEYP58557 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBEYP58557 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBEYP58557 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBEYP58557 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBEYP58557 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBEYP58557 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YBEYP58557 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBEYP58557 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBEYP58557 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBEYP58557 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBEYP58557 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBEYP58557 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YBEYP58557 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBEYP58557 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBEYP58557 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBEYP58557 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBEYP58557 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBEYP58557 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBEYP58557 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBEYP58557 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBEYP58557 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YBEYP58557 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YBEYP58557 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBEYP58557 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBEYP58557 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBEYP58557 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBEYP58557 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBEYP58557 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YBEYP58557 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBEYP58557 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBEYP58557 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBEYP58557 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBEYP58557 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBEYP58557 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBEYP58557 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBEYP58557 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBEYP58557 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBEYP58557 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBEYP58557 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBEYP58557 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBEYP58557 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBEYP58557 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBEYP58557 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBEYP58557 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBEYP58557 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YBEYP58557 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBEYP58557 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBEYP58557 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBEYP58557 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBEYP58557 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBEYP58557 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBEYP58557 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
YBEYP58557 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBEYP58557 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBEYP58557 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YBEYP58557 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
YBEYP58557 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
YBEYP58557 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
YBEYP58557 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBEYP58557 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBEYP58557 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBEYP58557 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBEYP58557 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBEYP58557 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBEYP58557 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBEYP58557 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YBEYP58557 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBEYP58557 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
YBEYP58557 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YBEYP58557 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms