Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXW4P57775 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXW4P57775 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms