Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GSDMDP57764 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms