Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP107P57740 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP107P57740 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP107P57740 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP107P57740 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP107P57740 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP107P57740 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP107P57740 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP107P57740 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP107P57740 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP107P57740 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP107P57740 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP107P57740 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP107P57740 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP107P57740 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP107P57740 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP107P57740 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP107P57740 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP107P57740 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP107P57740 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP107P57740 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP107P57740 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP107P57740 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP107P57740 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUP107P57740 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUP107P57740 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUP107P57740 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP107P57740 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP107P57740 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP107P57740 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP107P57740 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP107P57740 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP107P57740 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP107P57740 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP107P57740 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP107P57740 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP107P57740 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP107P57740 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP107P57740 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP107P57740 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP107P57740 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP107P57740 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP107P57740 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP107P57740 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP107P57740 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP107P57740 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP107P57740 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP107P57740 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP107P57740 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP107P57740 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP107P57740 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP107P57740 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP107P57740 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP107P57740 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP107P57740 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP107P57740 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP107P57740 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP107P57740 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP107P57740 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP107P57740 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP107P57740 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP107P57740 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP107P57740 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms