Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB38P57729 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB38P57729 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB38P57729 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB38P57729 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB38P57729 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB38P57729 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB38P57729 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB38P57729 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB38P57729 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB38P57729 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB38P57729 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB38P57729 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB38P57729 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB38P57729 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB38P57729 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB38P57729 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB38P57729 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB38P57729 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB38P57729 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB38P57729 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB38P57729 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB38P57729 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB38P57729 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB38P57729 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB38P57729 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB38P57729 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB38P57729 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB38P57729 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB38P57729 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB38P57729 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB38P57729 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB38P57729 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB38P57729 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB38P57729 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB38P57729 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB38P57729 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB38P57729 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB38P57729 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB38P57729 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB38P57729 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB38P57729 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB38P57729 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB38P57729 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB38P57729 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB38P57729 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB38P57729 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB38P57729 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB38P57729 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB38P57729 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB38P57729 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB38P57729 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB38P57729 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB38P57729 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB38P57729 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB38P57729 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB38P57729 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB38P57729 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB38P57729 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB38P57729 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB38P57729 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB38P57729 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms