Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIK1P57059 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SIK1P57059 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIK1P57059 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIK1P57059 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIK1P57059 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIK1P57059 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIK1P57059 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIK1P57059 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIK1P57059 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIK1P57059 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIK1P57059 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SIK1P57059 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SIK1P57059 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIK1P57059 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIK1P57059 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIK1P57059 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIK1P57059 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIK1P57059 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SIK1P57059 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIK1P57059 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIK1P57059 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIK1P57059 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIK1P57059 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SIK1P57059 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK1P57059 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK1P57059 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK1P57059 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK1P57059 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK1P57059 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK1P57059 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK1P57059 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK1P57059 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK1P57059 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK1P57059 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK1P57059 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK1P57059 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK1P57059 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK1P57059 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SIK1P57059 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK1P57059 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK1P57059 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK1P57059 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK1P57059 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK1P57059 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK1P57059 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK1P57059 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK1P57059 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK1P57059 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK1P57059 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK1P57059 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK1P57059 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK1P57059 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SIK1P57059 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIK1P57059 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIK1P57059 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIK1P57059 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIK1P57059 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIK1P57059 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SIK1P57059 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIK1P57059 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIK1P57059 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIK1P57059 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIK1P57059 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIK1P57059 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIK1P57059 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIK1P57059 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SIK1P57059 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIK1P57059 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIK1P57059 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIK1P57059 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIK1P57059 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SIK1P57059 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIK1P57059 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIK1P57059 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SIK1P57059 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SIK1P57059 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SIK1P57059 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SIK1P57059 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIK1P57059 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIK1P57059 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIK1P57059 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SIK1P57059 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIK1P57059 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIK1P57059 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SIK1P57059 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIK1P57059 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIK1P57059 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIK1P57059 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIK1P57059 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SIK1P57059 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK1P57059 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK1P57059 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK1P57059 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK1P57059 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK1P57059 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK1P57059 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK1P57059 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK1P57059 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK1P57059 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms