Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BACE1P56817 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BACE1P56817 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BACE1P56817 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BACE1P56817 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BACE1P56817 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BACE1P56817 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BACE1P56817 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BACE1P56817 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BACE1P56817 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BACE1P56817 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BACE1P56817 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BACE1P56817 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BACE1P56817 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BACE1P56817 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BACE1P56817 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BACE1P56817 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BACE1P56817 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BACE1P56817 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BACE1P56817 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BACE1P56817 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BACE1P56817 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BACE1P56817 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BACE1P56817 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BACE1P56817 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BACE1P56817 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BACE1P56817 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BACE1P56817 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BACE1P56817 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BACE1P56817 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BACE1P56817 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BACE1P56817 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BACE1P56817 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BACE1P56817 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BACE1P56817 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BACE1P56817 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BACE1P56817 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BACE1P56817 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BACE1P56817 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BACE1P56817 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BACE1P56817 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BACE1P56817 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BACE1P56817 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BACE1P56817 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BACE1P56817 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BACE1P56817 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BACE1P56817 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BACE1P56817 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BACE1P56817 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BACE1P56817 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BACE1P56817 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BACE1P56817 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BACE1P56817 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BACE1P56817 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BACE1P56817 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BACE1P56817 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BACE1P56817 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BACE1P56817 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BACE1P56817 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BACE1P56817 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BACE1P56817 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BACE1P56817 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BACE1P56817 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BACE1P56817 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BACE1P56817 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BACE1P56817 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BACE1P56817 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BACE1P56817 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BACE1P56817 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BACE1P56817 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BACE1P56817 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BACE1P56817 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BACE1P56817 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BACE1P56817 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BACE1P56817 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BACE1P56817 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BACE1P56817 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BACE1P56817 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BACE1P56817 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BACE1P56817 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BACE1P56817 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BACE1P56817 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms