Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SH3BGRP55822 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SH3BGRP55822 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms