Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFAP3P55082 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFAP3P55082 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MFAP3P55082 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFAP3P55082 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFAP3P55082 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFAP3P55082 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MFAP3P55082 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MFAP3P55082 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MFAP3P55082 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms