Protein–RNA interactions for Protein: P53980

YNL011C, Uncharacterized protein YNL011C, yeastyeast

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNL011CP53980 VPS69YPR087W 321 nt5.52□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 DCC1YCL016C 1143 nt5.52□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 PEX29YDR479C 1665 nt5.52□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 CTS1YLR286C 1689 nt5.52□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 THI21YPL258C 1656 nt5.52□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 STE7YDL159W 1548 nt5.52□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 MCH4YOL119C 1506 nt5.52□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 UGA2YBR006W 1494 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 NMD3YHR170W 1557 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 SPH1YLR313C 1593 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 TIF4632YGL049C 2745 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 RRF1YHR038W 693 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 YPT35YHR105W 645 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 PRP45YAL032C 1140 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 YKR011CYKR011C 1062 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 YLR257WYLR257W 966 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 YMR010WYMR010W 1218 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 FOL3YMR113W 1284 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 ATG8YBL078C 354 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 MRP21YBL090W 534 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 YOR263CYOR263C 408 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 YPL114WYPL114W 420 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 PRP28YDR243C 1767 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 RAT1YOR048C 3021 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 UBX3YDL091C 1368 nt5.51□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 POL12YBL035C 2118 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 SAC1YKL212W 1872 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 HCA4YJL033W 2313 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 APA2YDR530C 978 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 THG1YGR024C 714 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 RSR1YGR152C 819 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 YHR193C-AYHR193C-A 375 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 SDH3YKL141W 597 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 CSR1YLR380W 1227 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 UTP23YOR004W 765 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 MAK3YPR051W 531 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 TRM12YML005W 1389 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 CTT1YGR088W 1689 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 MKS1YNL076W 1755 nt5.5□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 YMR196WYMR196W 3267 nt5.49□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 RXT3YDL076C 885 nt5.49□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 TAF10YDR167W 621 nt5.49□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 IZH1YDR492W 951 nt5.49□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.49□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt5.49□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 YJL175WYJL175W 513 nt5.49□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 PRM6YML047C 1059 nt5.49□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 YNL046WYNL046W 519 nt5.49□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 KRE29YER038C 1395 nt5.49□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 ITT1YML068W 1395 nt5.49□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 THI20YOL055C 1656 nt5.49□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 KRS1YDR037W 1776 nt5.48□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 GLO3YER122C 1482 nt5.48□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 CYC1YJR048W 330 nt5.48□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt5.48□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 SRP40YKR092C 1221 nt5.48□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 GIM5YML094W 492 nt5.48□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 YBL044WYBL044W 369 nt5.48□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 LEM3YNL323W 1245 nt5.48□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 BLM10YFL007W 6432 nt5.48□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 NGG1YDR176W 2109 nt5.48□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 TRM44YPL030W 1704 nt5.48□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 DAK1YML070W 1755 nt5.47□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 SUM1YDR310C 3189 nt5.47□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 YFL034WYFL034W 3222 nt5.47□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 ATG20YDL113C 1923 nt5.47□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 MDM34YGL219C 1380 nt5.47□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 ULA1YPL003W 1389 nt5.47□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 SPB4YFL002C 1821 nt5.47□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 YDR134CYDR134C 411 nt5.47□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 SLF1YDR515W 1344 nt5.47□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 AGA1YNR044W 2178 nt5.46□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 SAP155YFR040W 3009 nt5.46□□□□□ -1.53
YNL011CP53980 RPS11AYDR025W 471 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 YDR271CYDR271C 372 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 MAM1YER106W 909 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 PEA2YER149C 1263 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 LOC1YFR001W 615 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 YJR020WYJR020W 333 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 YJR087WYJR087W 351 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 SRP21YKL122C 504 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 YAR023CYAR023C 540 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 COQ9YLR201C 783 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 TDA5YLR426W 981 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 YMR310CYMR310C 954 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 PRM3YPL192C 402 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 NOP56YLR197W 1515 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 ZUO1YGR285C 1302 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 YAP1YML007W 1953 nt5.46□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 RIM21YNL294C 1602 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 TSC13YDL015C 933 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 RRP45YDR280W 918 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 YDR491CYDR491C 492 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 NSA2YER126C 786 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 RTR1YER139C 681 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 YER165C-AYER165C-A 357 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 UPF3YGR072W 1164 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt5.45□□□□□ -1.54
YNL011CP53980 ATG27YJL178C 816 nt5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.8 ms