Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACLYP53396 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACLYP53396 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACLYP53396 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ACLYP53396 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ACLYP53396 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACLYP53396 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACLYP53396 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ACLYP53396 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACLYP53396 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACLYP53396 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACLYP53396 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACLYP53396 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACLYP53396 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACLYP53396 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACLYP53396 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACLYP53396 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACLYP53396 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACLYP53396 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACLYP53396 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACLYP53396 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACLYP53396 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACLYP53396 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACLYP53396 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ACLYP53396 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACLYP53396 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACLYP53396 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACLYP53396 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACLYP53396 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACLYP53396 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACLYP53396 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACLYP53396 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACLYP53396 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACLYP53396 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACLYP53396 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACLYP53396 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACLYP53396 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ACLYP53396 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACLYP53396 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACLYP53396 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACLYP53396 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACLYP53396 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACLYP53396 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACLYP53396 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACLYP53396 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACLYP53396 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACLYP53396 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACLYP53396 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACLYP53396 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACLYP53396 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACLYP53396 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACLYP53396 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACLYP53396 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACLYP53396 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACLYP53396 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACLYP53396 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACLYP53396 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ACLYP53396 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACLYP53396 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACLYP53396 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACLYP53396 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACLYP53396 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACLYP53396 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACLYP53396 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACLYP53396 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACLYP53396 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACLYP53396 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ACLYP53396 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACLYP53396 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACLYP53396 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACLYP53396 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACLYP53396 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACLYP53396 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACLYP53396 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
ACLYP53396 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACLYP53396 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACLYP53396 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ACLYP53396 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ACLYP53396 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ACLYP53396 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACLYP53396 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACLYP53396 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ACLYP53396 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACLYP53396 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACLYP53396 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACLYP53396 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACLYP53396 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACLYP53396 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACLYP53396 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACLYP53396 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ACLYP53396 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ACLYP53396 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ACLYP53396 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACLYP53396 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACLYP53396 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACLYP53396 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ACLYP53396 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ACLYP53396 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACLYP53396 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACLYP53396 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms