Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK3P51956 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK3P51956 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK3P51956 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK3P51956 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK3P51956 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK3P51956 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK3P51956 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK3P51956 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NEK3P51956 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK3P51956 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK3P51956 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK3P51956 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK3P51956 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK3P51956 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK3P51956 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK3P51956 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK3P51956 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK3P51956 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK3P51956 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NEK3P51956 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NEK3P51956 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK3P51956 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK3P51956 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK3P51956 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK3P51956 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK3P51956 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK3P51956 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK3P51956 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK3P51956 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK3P51956 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK3P51956 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK3P51956 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK3P51956 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK3P51956 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NEK3P51956 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK3P51956 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK3P51956 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK3P51956 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK3P51956 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK3P51956 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK3P51956 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK3P51956 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK3P51956 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NEK3P51956 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK3P51956 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK3P51956 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK3P51956 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK3P51956 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK3P51956 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK3P51956 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK3P51956 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK3P51956 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK3P51956 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK3P51956 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK3P51956 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK3P51956 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK3P51956 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK3P51956 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NEK3P51956 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK3P51956 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK3P51956 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK3P51956 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK3P51956 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK3P51956 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK3P51956 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK3P51956 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK3P51956 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NEK3P51956 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK3P51956 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK3P51956 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK3P51956 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK3P51956 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK3P51956 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK3P51956 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK3P51956 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK3P51956 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK3P51956 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK3P51956 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK3P51956 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK3P51956 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK3P51956 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NEK3P51956 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms