Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSFMP43897 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSFMP43897 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSFMP43897 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TSFMP43897 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSFMP43897 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSFMP43897 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSFMP43897 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSFMP43897 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSFMP43897 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSFMP43897 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSFMP43897 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSFMP43897 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSFMP43897 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TSFMP43897 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSFMP43897 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TSFMP43897 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSFMP43897 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSFMP43897 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSFMP43897 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TSFMP43897 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSFMP43897 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSFMP43897 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSFMP43897 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSFMP43897 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSFMP43897 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSFMP43897 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSFMP43897 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSFMP43897 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSFMP43897 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TSFMP43897 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TSFMP43897 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TSFMP43897 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSFMP43897 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSFMP43897 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSFMP43897 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSFMP43897 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSFMP43897 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSFMP43897 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TSFMP43897 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSFMP43897 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSFMP43897 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TSFMP43897 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSFMP43897 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSFMP43897 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSFMP43897 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSFMP43897 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSFMP43897 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSFMP43897 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSFMP43897 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TSFMP43897 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
TSFMP43897 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSFMP43897 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSFMP43897 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSFMP43897 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TSFMP43897 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSFMP43897 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSFMP43897 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSFMP43897 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSFMP43897 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSFMP43897 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSFMP43897 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSFMP43897 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSFMP43897 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TSFMP43897 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSFMP43897 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSFMP43897 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSFMP43897 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSFMP43897 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TSFMP43897 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSFMP43897 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSFMP43897 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSFMP43897 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSFMP43897 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSFMP43897 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSFMP43897 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSFMP43897 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSFMP43897 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSFMP43897 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms