Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
APOBEC1P41238 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
APOBEC1P41238 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms